I. Przedmioty filozoficzne
Historia filozofii i współczesne kierunki filozoficzne
Metafizyka
Antropologia filozoficzna
Filozofia przyrody
Teoria poznania
Etyka
Ogólna metodologia nauk
Logika
Filozofia Boga
II. Przedmioty teologiczne
Przedmioty biblijno-patrologiczne
Wprowadzenie do Pisma Świętego
Egzegeza Starego Testamentu
Egzegeza Nowego Testamentu
Teologia biblijna
Patrologia
Teologia systematyczna
Religiologia
Teologia fundamentalna
Teologia dogmatyczna
Ekumenizm
Teologia moralna i duchowość
Teologia moralna ogólna
Teologia moralna szczegółowa
Teologia moralna (sakramenty uzdrowienia)
Teologia duchowości
Katolicka nauka społeczna
Przedmioty historyczno-prawne
Historia Kościoła
Prawo kanoniczne i wyznaniowe
Przedmioty pastoralne
Teologia pastoralna
Liturgika
Muzyka kościelna
Homiletyka
Fonetyka pastoralna
III. Przedmioty psychologiczno-poedagogiczno-katechetyczne
Psychologia ogólna
Psychologia rozwojowa
Psychologia pastoralna
Pedagogika z dydaktyką
Katechetyka
IV. Zajęcia związane z pisaniem pracy naukowej
Proseminarium
Seminarium naukowe
Konwersatorium z przedmiotu seminaryjnego
Wykład monograficzny
V. Przedmioty z zakresu franciszkanizmu
Pisma św. Franciszka i św. Klary
Hagiografia franciszkańska
Historia duchowości franciszkańskiej
Duchowość brata mniejszego konwentualnego (OFM Conv.)
Szkoła franciszkańska
Duszpasterstwo franciszkańskie
Ekologia
VI. Inne przedmioty fakultatywne
Historia sztuki i zasady konserwacji zabytków
Kierownictwo duchowe
Misjologia
Prawo zakonne
Massmedia w duszpasterstwie
VII. Lektoraty
Język łaciński
Język grecki
Język nowożytny – włoski, angielski lub niemiecki